Новый этап истории кафедры связан с переменами в стране, наступившими на рубеже 1980–1990-х годов. В эти годы кафедру возглавляли: в 1986–1991 годы – профессор М.Е. Сучков, в 1991–2006 годы – доцент Н.С. Ватник. С 2006 по 2022 годы кафедру возглавлял профессор Д.В. Ковалев, с 2022 г. — доцент А.Ю. Никандров.
В сентябре 2019 года на основании решения Ученого совета университета кафедра была переименована в кафедру Отечественной и всеобщей истории и муниципального управления. Кафедра является выпускающей по трём направлениям подготовки бакалавров: "Педагогическое образование", "Государственное и муниципальное управление" и «Туризм» (новое направление, открытое в 2020 году)
В настоящее время 100 % преподавателей кафедры имеют учёную степень и звание. Преподаватели кафедры являются лауреатами научных конкурсов всероссийского и международного уровней, активными участниками различных программ по проблемам изучения истории, участвуют в международных, российских и региональных конференциях, конгрессах, симпозиумах. На базе Университета регулярно проводятся научные встречи.
Ежегодно центральными издательствами и издательством Университета публикуются подготовленные преподавателями кафедры монографии по отечественной и всеобщей истории, истории Московской области и Коломны, учебные и учебно-методические пособия, сборники научных трудов.
Известность получили научные школы по аграрной истории (доктор исторических наук В.М. Андреев, доктор исторических наук Ковалёв Д.В.), средневековой истории России (доктор исторических наук А.Б. Мазуров), истории России XIX в. – начала XX вв. (кандидат исторических наук Н.С. Ватник), региональной истории и краеведению (канд. ист. наук А.А. Шаблин), археологии (кандидат исторических наук А.С. Сыроватко). Преподавателями кафедры проводится научная разработка проблем экономической истории и истории международных отношений.
В настоящее время штатные преподаватели кафедры работают над различными аспектами общей темы "Исследование социально-экономических и политических процессов, культуры Подмосковья в XI – XX вв.". За последние десять лет ими было опубликовано 16 монографий, 2 сборника очерков, 4 сборника документов и материалов, 13 учебных пособий, 18 учебно-методических изданий и справочно-библиографических изданий и 547 статей (в т.ч. 83 в центральных и зарубежных изданиях, Большой российской энциклопедии) и тезисов на научных конференциях. Защищены 11 кандидатских диссертаций. Преподаватели регулярно становятся обладателями федеральных научных грантов.
Научные труды представителей кафедры неоднократно удостаивались престижных наград, в частности: монография профессора А.Б. Мазурова и доцента А.Ю. Никандрова "Русский удел эпохи создания единого Русского государства: Серпуховское княжение в середине XIV – первой половине XV вв." в 2009 году была признана лучшей научной книгой в номинации "Общественные и гуманитарные науки" в рамках Всероссийского конкурса, организованного Фондом развития Отечественного образования. Лауреатами этого конкурса в разные года являлись: в 2007 году – доцент А.А. Шаблин (монография "Старые Луховицы. Культура местного сообщества в меняющемся мире"), в 2012 году – доцент Л.Н. Соза (монография "Пореформенная Коломна: на пути к промышленному городу"), в 2015 году – профессор А.Б. Мазуров (монография "Коломенский кремль – символ России и Подмосковья: история выдающегося памятника русского оборонного зодчества"), в 2016 году – доцент О.И. Галкина в соавторстве с проф. П.В. Галкиным (монография "История нотариата Московской области").
В 2012 году проф. А.Б. Мазуров награждён памятной медалью имени митрополита Московского и Коломенского Макария "За выдающийся вклад в историческую науку", а в 2014 году – стал победителем Международного конкурса "Лучшая книга в гуманитарной сфере" как член авторского коллектива монографий "Духовно-нравственное воспитание: от теории к практике" и "Духовно-нравственное воспитание в вузе: образовательный и интеллектуальный потенциал". В 2016 году профессору А.Б. Мазурову за достижения в научных исследованиях по истории России и Русской Православной Церкви и в популяризации научно-исторических знаний вручена медаль РПЦ "200 лет со дня рождения митрополита Макария (Булгакова)". В 2022 году профессору Мазурову Алексею Борисовичу присвоено звание «Почётный гражданин городского округа Коломна»
В 2013 году исследовательский проект доцента А.С. Сыроватко "Щуровский могильник в контексте проблемы "Тёмных веков"" победил в областном конкурсе социальных инициатив "Наше Подмосковье" в номинации "Научный прорыв". Доцент Н.С. Ватник награжден Дипломом Общественного Совета по содействию Государственной комиссии по подготовке к празднованию 200-летия победы России в Отечественной войне 1812 года за исследование и публикации о памятных местах Коломны, связанных с Отечественной войной 1812 года, а также медалью "И.И. Лажечникова" за большой вклад в развитие литературно-исторических традиций. В 2015 году проект доцента Л.Н. Соза "Монографическое исследование Коломны последней трети XIX – начала ХХ вв." удостоился премии Губернатора Московской области "Наше Подмосковье" в номинации "Связь времен".
Тесные связи поддерживаются с Институтом российской истории РАН, Институтом всеобщей истории РАН и ведущими вузами Москвы – Московским государственным университетом им. М.В. Ломоносова, Московским государственным педагогическим университетом, Московским государственным открытым педагогическим университетом, Московским государственным областным университетом, Российским государственным гуманитарным университетом, Российским экономическим университетом им. Г.В. Плеханова, вузами Санкт-Петербурга, Рязани, Тулы, Белгорода. Налажены прочные связи с Егорьевским, Ступинским, Зарайским, Серпуховским, Коломенским музеями, Луховицким и Коломенским клубами краеведов, Союзом краеведов России. Активно развивается международное научное сотрудничество в рамках совместных исследовательских и научно-педагогических проектов с коллегами из зарубежных университетов – Белорусско-российского университета, Могилёвского государственного университета им. А.А.Кулёшова.
Активно действует студенческое научное общество, через которое студенты под руководством опытных преподавателей приобщаются к научным исследованиям. С 2005 года кафедра отечественной и всеобщей истории стала инициатором проведения ежегодной региональной (с 2015 года – всероссийской с международным участием) конференции "Студенческая молодёжь и общественные науки". В настоящее время она является фундаментальной площадкой для апробации научных исследований молодёжи со всей России.
С 2013 года преподаватели кафедры успешно руководят участием студентов в Открытых международных студенческих Интернет-олимпиадах по истории и культурологии.
Студенты с интересом проходят археологическую и педагогическую практику. Лучшие студенческие работы публикуются в институтских и межвузовских научных сборниках. Их авторы поступают в аспирантуру Университета, научных и образовательных учреждений Москвы.
Лучшим показателем эффективной подготовки кадров являются выпускники, которые успешно трудоустраиваются по специальности.
Преподавателями кафедры разработаны программы для учителей истории и обществознания, реализуемые на факультете повышения квалификации и профессиональной переподготовки. С участием преподавателей кафедры для школьников на базе Университета проводится Всероссийская Толстовская Олимпиада и Олимпиада по истории российского предпринимательства, для будущих абитуриентов ежегодно работает школа Юного историка-обществоведа.
Кафедра активно сотрудничает со школами юго-восточного региона Московской области, ведет активную научную и методическую работу. Статьи и монографии публикуются в различных изданиях, в том числе, в центральных и международных.
На данный момент по кафедре реализуются образовательные программы трёх ступеней высшего образования:
- бакалавриат (направление подготовки 44.03.05 – Педагогическое образование (с двумя профилями подготовки "История", "Обществознание"); направление подготовки 44.03.01 – Педагогическое образование (профиль "История"); направление подготовки 38.03.04 – Государственное и муниципальное управление (профиль "Государственное и муниципальное управление"); направление подготовки 43.03.02 - Туризм (профиль Историко-культурный туризм);
- магистратура (направление подготовки 44.04.01 – Педагогическое образование, профиль "История и краеведение");
- аспирантура (направление подготовки 46.06.01 – Исторические науки и археология (профиль 07.00.02 "Отечественная история").